Спектральные характеристики комплексов тетра- и трикатионных порфиринов с двухцепочечной ДНК

  • Наталья Шамильевна Лебедева
  • Елена Сергеевна Юрина
  • Михаил Александрович Лебедев
  • Алексей Николаевич Киселев
  • Сергей Александрович Сырбу
  • Юрий Губарев ИХР РАН
Ключевые слова: Порфирины, ДНК, флуоресценция

Аннотация

Проведено систематическое спектральное исследование взаимодействия ДНК с рядом тетра- и три- катионных порфиринов, в которых N-метильная группа расположена в пара- или мета-положении пиридильного заместителя. Установлены условия образования интеркаляционных комплексов ДНК с изученными порфиринами. Показано, что ДНК проявляет большую аффинность к порфиринам с N-метильной группой в пара-положении периферийного заместителя, по сравнению с порфиринами с N-метильной группой в мета-положении. Интеркаляционные комплексы ДНК с порфиринами с мета-положением N-метильной группы характеризуются спектральными особенностями, такими как: небольшой батохромный сдвиг полосы Соре, спектр излучения интеркалированных порфиринов без инверсии полос. Для комплексов ДНК с моногетарилзамещенными порфиринами предложена модель связывания – «полуинтеркаляционная».

Литература

Trannoy L.L., Lagerberg J.W., Dubbelman T.M., Schuitmaker H.J., Brand A. Transfusion 2004, 44, 1186.

https://doi.org/10.1111/j.1537-2995.2004.03275.x

Otvagin V.F., Nyuchev A.V., Kuzmina N.S., Grishin I.D., Gavryushin A.E., Romanenko Y.V., Koifman O.I., Belykh D.V., Peskova N.N., Shilyagina N.Y. Eur. J. Med. Chem. 2018, 144, 740.

https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2017.12.062

Fiel R.J. J. Biomol. Struct. Dyn. 1989, 6, 1259.

https://doi.org/10.1080/07391102.1989.10506549

Fiel R., Munson B. Nucleic Acids Res. 1980, 8, 2835.

https://doi.org/10.1093/nar/8.12.2835

Marzilli L., Banville D., Zon G., Wilson W. J. Am. Chem. Soc 1986, 108, 4188.

https://doi.org/10.1021/ja00274a056

Lipscomb L.A., Zhou F.X., Presnell S.R., Woo R.J., Peek M.E., Plaskon R.R., Williams L.D. Biochemistry 1996, 35, 2818.

https://doi.org/10.1021/bi952443z

Pratviel G., Pitié M., Bernadou J., Meunier B. Angew. Chem. Int. Ed. 1991, 30, 702.

https://doi.org/10.1002/anie.199107021

Kumar S., Cheng X., Klimasauskas S., Mi S., Posfai J., Roberts R.J., Wilson G.G. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 1.

https://doi.org/10.1093/nar/22.1.1

Savva R., Pearl L.H. Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 752.

https://doi.org/10.1038/nsb0995-752

Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Syrbu S.A. Spectrochim. Acta A 2018, 199, 235.

https://doi.org/10.1016/j.saa.2018.03.066

Gubarev Y.A., Lebedeva N.S., Yurina E.S., Syrbu S.A., Kiselev A.N., Lebedev M.A. J. Pharmaceut. Analysis 2021, 11, 691-698.

https://doi.org/10.1016/j.jpha.2021.08.003

Peacocke A., Skerrett J.H. Trans. Faraday Soc. 1956, 52, 261.

https://doi.org/10.1039/tf9565200261

Walker G.T., Stone M.P., Krugh T.R. Biochemistry 1985, 24, 7462.

https://doi.org/10.1021/bi00346a065

Nafisi S., Saboury A.A., Keramat N., Neault J.-F., Tajmir-Riahi H.-A. J. Mol. Struct. 2007, 827, 35.

https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2006.05.004

Dharanivasan G., Jesse D.M.I., Chandirasekar S., Rajendiran N., Kathiravan K. J. Fluoresc. 2014, 24, 1397.

https://doi.org/10.1007/s10895-014-1417-9

Pasternack R.F., Caccam M., Keogh B., Stephenson T.A., Williams A.P., Gibbs E.J. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6835.

https://doi.org/10.1021/ja00018a019

Kang J., Wu H., Lu X., Wang Y., Zhou L. Spectrochim. Acta A 2005, 61, 2041.

https://doi.org/10.1016/j.saa.2004.08.009

Pratviel G. Coord. Chem. Rev. 2016, 308, 460.

https://doi.org/10.1016/j.ccr.2015.07.003

Lebedeva N. S., Malkova E., Popova T., Kutyrev A., Syrbu S., Parfenyuk E., Vyugin A. Spectrochim. Acta A 2014, 118, 395.

https://doi.org/10.1016/j.saa.2013.06.101

Опубликован
2022-06-26
Раздел
Порфирины